Akcja Far Cry 5 toczy się na terenie fikcyjnego hrabstwa Hope w amerykańskim stanie Montanta. Gracz wciela się w policjanta lub policjantkę, a jego zadaniem jest rozpracowanie i zniszczenie fanatycznego kultu religijnego, znanego pod nazwą Projektu u Bram Edenu. Na czele grupy stoi Joseph Seed, w bezwzględny sposób rozprawiający się z tymi, których uważa za grzeszników. Po raz kolejny w historii serii mamy więc do czynienia z okrutnym, ale charyzmatycznym złoczyńcą. Protagonista (lub protagonistka) nie jest jednak sam – w toku przygody dołączają do niego sojusznicy, tacy jak snajperka Grace Armstrong, Nick Rye (zapalony pilot obawiający się o swoją rodzinę), Adelaide Drubman (pilotująca uzbrojony w działka śmigłowiec), znany z poprzednich odsłon Hurk Drubman Jr czy oswojone zwierzaki: puma, pies i ogromny niedźwiedź.